Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTPRNQ16849 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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PTPRNQ16849 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRNQ16849 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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