Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
AP3B2Q13367 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
AP3B2Q13367 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
AP3B2Q13367 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
AP3B2Q13367 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
AP3B2Q13367 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
AP3B2Q13367 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
AP3B2Q13367 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
AP3B2Q13367 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
AP3B2Q13367 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
AP3B2Q13367 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
AP3B2Q13367 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
AP3B2Q13367 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
AP3B2Q13367 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
AP3B2Q13367 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
AP3B2Q13367 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
AP3B2Q13367 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
AP3B2Q13367 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
AP3B2Q13367 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
AP3B2Q13367 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
AP3B2Q13367 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
AP3B2Q13367 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
AP3B2Q13367 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
AP3B2Q13367 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
AP3B2Q13367 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
AP3B2Q13367 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
AP3B2Q13367 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
AP3B2Q13367 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
AP3B2Q13367 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
AP3B2Q13367 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
AP3B2Q13367 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
AP3B2Q13367 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
AP3B2Q13367 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
AP3B2Q13367 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
AP3B2Q13367 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
AP3B2Q13367 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
AP3B2Q13367 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
AP3B2Q13367 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
AP3B2Q13367 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
AP3B2Q13367 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
AP3B2Q13367 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
AP3B2Q13367 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
AP3B2Q13367 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
AP3B2Q13367 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
AP3B2Q13367 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
AP3B2Q13367 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
AP3B2Q13367 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
AP3B2Q13367 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
AP3B2Q13367 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
AP3B2Q13367 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
AP3B2Q13367 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
AP3B2Q13367 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
AP3B2Q13367 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
AP3B2Q13367 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
AP3B2Q13367 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
AP3B2Q13367 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
AP3B2Q13367 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
AP3B2Q13367 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
AP3B2Q13367 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
AP3B2Q13367 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
AP3B2Q13367 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
AP3B2Q13367 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
AP3B2Q13367 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
AP3B2Q13367 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
AP3B2Q13367 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
AP3B2Q13367 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
AP3B2Q13367 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
AP3B2Q13367 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
AP3B2Q13367 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
AP3B2Q13367 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
AP3B2Q13367 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
AP3B2Q13367 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
AP3B2Q13367 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
AP3B2Q13367 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
AP3B2Q13367 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
AP3B2Q13367 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
AP3B2Q13367 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
AP3B2Q13367 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
AP3B2Q13367 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
AP3B2Q13367 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
AP3B2Q13367 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
AP3B2Q13367 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
AP3B2Q13367 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
AP3B2Q13367 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
AP3B2Q13367 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
AP3B2Q13367 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
AP3B2Q13367 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
AP3B2Q13367 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
AP3B2Q13367 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
AP3B2Q13367 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
AP3B2Q13367 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
AP3B2Q13367 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
AP3B2Q13367 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
AP3B2Q13367 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
AP3B2Q13367 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
AP3B2Q13367 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
AP3B2Q13367 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
AP3B2Q13367 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
AP3B2Q13367 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
AP3B2Q13367 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms