Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CSPP1Q1MSJ5 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.72
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
CSPP1Q1MSJ5 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
CSPP1Q1MSJ5 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.3 ms