Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PARP3Q9Y6F1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PARP3Q9Y6F1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PARP3Q9Y6F1 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PARP3Q9Y6F1 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PARP3Q9Y6F1 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PARP3Q9Y6F1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PARP3Q9Y6F1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PARP3Q9Y6F1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PARP3Q9Y6F1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PARP3Q9Y6F1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PARP3Q9Y6F1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PARP3Q9Y6F1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PARP3Q9Y6F1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PARP3Q9Y6F1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PARP3Q9Y6F1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PARP3Q9Y6F1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PARP3Q9Y6F1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PARP3Q9Y6F1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PARP3Q9Y6F1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PARP3Q9Y6F1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PARP3Q9Y6F1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PARP3Q9Y6F1 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PARP3Q9Y6F1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PARP3Q9Y6F1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PARP3Q9Y6F1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PARP3Q9Y6F1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PARP3Q9Y6F1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PARP3Q9Y6F1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PARP3Q9Y6F1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PARP3Q9Y6F1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PARP3Q9Y6F1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PARP3Q9Y6F1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PARP3Q9Y6F1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PARP3Q9Y6F1 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PARP3Q9Y6F1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PARP3Q9Y6F1 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PARP3Q9Y6F1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PARP3Q9Y6F1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PARP3Q9Y6F1 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PARP3Q9Y6F1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PARP3Q9Y6F1 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PARP3Q9Y6F1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PARP3Q9Y6F1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PARP3Q9Y6F1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PARP3Q9Y6F1 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PARP3Q9Y6F1 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PARP3Q9Y6F1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PARP3Q9Y6F1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PARP3Q9Y6F1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PARP3Q9Y6F1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PARP3Q9Y6F1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PARP3Q9Y6F1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PARP3Q9Y6F1 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PARP3Q9Y6F1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PARP3Q9Y6F1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PARP3Q9Y6F1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PARP3Q9Y6F1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms