Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms