Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E1

WASHC2C, WASH complex subunit 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2CQ9Y4E1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
WASHC2CQ9Y4E1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
WASHC2CQ9Y4E1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
WASHC2CQ9Y4E1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
WASHC2CQ9Y4E1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
WASHC2CQ9Y4E1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
WASHC2CQ9Y4E1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
WASHC2CQ9Y4E1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
WASHC2CQ9Y4E1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
WASHC2CQ9Y4E1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
WASHC2CQ9Y4E1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
WASHC2CQ9Y4E1 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
WASHC2CQ9Y4E1 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
WASHC2CQ9Y4E1 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
WASHC2CQ9Y4E1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
WASHC2CQ9Y4E1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
WASHC2CQ9Y4E1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
WASHC2CQ9Y4E1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
WASHC2CQ9Y4E1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
WASHC2CQ9Y4E1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
WASHC2CQ9Y4E1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
WASHC2CQ9Y4E1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
WASHC2CQ9Y4E1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
WASHC2CQ9Y4E1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
WASHC2CQ9Y4E1 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
WASHC2CQ9Y4E1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
WASHC2CQ9Y4E1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
WASHC2CQ9Y4E1 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
WASHC2CQ9Y4E1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
WASHC2CQ9Y4E1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
WASHC2CQ9Y4E1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
WASHC2CQ9Y4E1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
WASHC2CQ9Y4E1 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
WASHC2CQ9Y4E1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
WASHC2CQ9Y4E1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
WASHC2CQ9Y4E1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
WASHC2CQ9Y4E1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
WASHC2CQ9Y4E1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
WASHC2CQ9Y4E1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
WASHC2CQ9Y4E1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
WASHC2CQ9Y4E1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
WASHC2CQ9Y4E1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
WASHC2CQ9Y4E1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
WASHC2CQ9Y4E1 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
WASHC2CQ9Y4E1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
WASHC2CQ9Y4E1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
WASHC2CQ9Y4E1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
WASHC2CQ9Y4E1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
WASHC2CQ9Y4E1 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
WASHC2CQ9Y4E1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
WASHC2CQ9Y4E1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
WASHC2CQ9Y4E1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms