Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHTOPQ9Y3Y2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms