Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms