Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COPS3Q9UNS2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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