Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ALKQ9UM73 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms