Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB23Q9ULC3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB23Q9ULC3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB23Q9ULC3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB23Q9ULC3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB23Q9ULC3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms