Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX3

MYH13, Myosin-13, humanhuman

Predictions only

Length 1,938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH13Q9UKX3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYH13Q9UKX3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYH13Q9UKX3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYH13Q9UKX3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYH13Q9UKX3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYH13Q9UKX3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYH13Q9UKX3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYH13Q9UKX3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYH13Q9UKX3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MYH13Q9UKX3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYH13Q9UKX3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYH13Q9UKX3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYH13Q9UKX3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYH13Q9UKX3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYH13Q9UKX3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYH13Q9UKX3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MYH13Q9UKX3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYH13Q9UKX3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYH13Q9UKX3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYH13Q9UKX3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYH13Q9UKX3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYH13Q9UKX3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYH13Q9UKX3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYH13Q9UKX3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYH13Q9UKX3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYH13Q9UKX3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYH13Q9UKX3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYH13Q9UKX3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYH13Q9UKX3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYH13Q9UKX3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYH13Q9UKX3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYH13Q9UKX3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYH13Q9UKX3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYH13Q9UKX3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYH13Q9UKX3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYH13Q9UKX3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYH13Q9UKX3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYH13Q9UKX3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYH13Q9UKX3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYH13Q9UKX3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYH13Q9UKX3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MYH13Q9UKX3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYH13Q9UKX3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MYH13Q9UKX3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MYH13Q9UKX3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms