Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCAN3Q9UKA8 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms