Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN11AQ9UI33 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SCN11AQ9UI33 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN11AQ9UI33 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN11AQ9UI33 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN11AQ9UI33 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN11AQ9UI33 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN11AQ9UI33 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN11AQ9UI33 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN11AQ9UI33 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN11AQ9UI33 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN11AQ9UI33 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN11AQ9UI33 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN11AQ9UI33 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN11AQ9UI33 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN11AQ9UI33 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN11AQ9UI33 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN11AQ9UI33 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN11AQ9UI33 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms