Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NPC1L1Q9UHC9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms