Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HMGXB4Q9UGU5 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HMGXB4Q9UGU5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HMGXB4Q9UGU5 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HMGXB4Q9UGU5 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HMGXB4Q9UGU5 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HMGXB4Q9UGU5 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HMGXB4Q9UGU5 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HMGXB4Q9UGU5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGXB4Q9UGU5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGXB4Q9UGU5 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGXB4Q9UGU5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGXB4Q9UGU5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGXB4Q9UGU5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGXB4Q9UGU5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGXB4Q9UGU5 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGXB4Q9UGU5 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGXB4Q9UGU5 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGXB4Q9UGU5 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGXB4Q9UGU5 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGXB4Q9UGU5 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGXB4Q9UGU5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGXB4Q9UGU5 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGXB4Q9UGU5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGXB4Q9UGU5 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGXB4Q9UGU5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGXB4Q9UGU5 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGXB4Q9UGU5 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGXB4Q9UGU5 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGXB4Q9UGU5 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGXB4Q9UGU5 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGXB4Q9UGU5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGXB4Q9UGU5 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGXB4Q9UGU5 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms