Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms