Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM4

BICRA, BRD4-interacting chromatin-remodeling complex-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICRAQ9NZM4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
BICRAQ9NZM4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
BICRAQ9NZM4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
BICRAQ9NZM4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
BICRAQ9NZM4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
BICRAQ9NZM4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
BICRAQ9NZM4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
BICRAQ9NZM4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
BICRAQ9NZM4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
BICRAQ9NZM4 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
BICRAQ9NZM4 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC35.15■■■■□ 3.22
BICRAQ9NZM4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
BICRAQ9NZM4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
BICRAQ9NZM4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
BICRAQ9NZM4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
BICRAQ9NZM4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
BICRAQ9NZM4 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
BICRAQ9NZM4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
BICRAQ9NZM4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
BICRAQ9NZM4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
BICRAQ9NZM4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
BICRAQ9NZM4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
BICRAQ9NZM4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
BICRAQ9NZM4 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
BICRAQ9NZM4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
BICRAQ9NZM4 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC35.14■■■■□ 3.22
BICRAQ9NZM4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
BICRAQ9NZM4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
BICRAQ9NZM4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
BICRAQ9NZM4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
BICRAQ9NZM4 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
BICRAQ9NZM4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
BICRAQ9NZM4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
BICRAQ9NZM4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
BICRAQ9NZM4 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.22
BICRAQ9NZM4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.22
BICRAQ9NZM4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.22
BICRAQ9NZM4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC35.13■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC35.1■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC35.08■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
BICRAQ9NZM4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms