Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DNAJC28Q9NX36 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms