Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWA0

MED9, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED9Q9NWA0 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MED9Q9NWA0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms