Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB4Q9NTQ9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms