Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNBIP1Q9NSA3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms