Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS45Q9NRW7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS45Q9NRW7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS45Q9NRW7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS45Q9NRW7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS45Q9NRW7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS45Q9NRW7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS45Q9NRW7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS45Q9NRW7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS45Q9NRW7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS45Q9NRW7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS45Q9NRW7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS45Q9NRW7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS45Q9NRW7 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS45Q9NRW7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS45Q9NRW7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS45Q9NRW7 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS45Q9NRW7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS45Q9NRW7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS45Q9NRW7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS45Q9NRW7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS45Q9NRW7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS45Q9NRW7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS45Q9NRW7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS45Q9NRW7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS45Q9NRW7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms