Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNNM1Q9NRU3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNNM1Q9NRU3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms