Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TULP4Q9NRJ4 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms