Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHST12Q9NRB3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHST12Q9NRB3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms