Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FANCFQ9NPI8 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FANCFQ9NPI8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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