Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 CTXN3-204ENST00000620385 1208 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 AP000959.1-201ENST00000441759 977 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 AC013731.1-201ENST00000604340 883 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 ZNF626-201ENST00000291750 1123 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 NPM1P31-201ENST00000399021 764 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 LYVE1-203ENST00000529598 936 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 OR4A19P-201ENST00000533579 1103 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 NUCKS1P1-201ENST00000452067 703 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 MGST3-204ENST00000367888 778 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SENP3Q9H4L4 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms