Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PDCL3Q9H2J4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDCL3Q9H2J4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDCL3Q9H2J4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDCL3Q9H2J4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDCL3Q9H2J4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDCL3Q9H2J4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDCL3Q9H2J4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDCL3Q9H2J4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDCL3Q9H2J4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDCL3Q9H2J4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDCL3Q9H2J4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PDCL3Q9H2J4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDCL3Q9H2J4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDCL3Q9H2J4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDCL3Q9H2J4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDCL3Q9H2J4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDCL3Q9H2J4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDCL3Q9H2J4 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDCL3Q9H2J4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDCL3Q9H2J4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDCL3Q9H2J4 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDCL3Q9H2J4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms