Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC90BQ9GZT6 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC90BQ9GZT6 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms