Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms