Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NLRP1Q9C000 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms