Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NSD3Q9BZ95 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NSD3Q9BZ95 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NSD3Q9BZ95 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NSD3Q9BZ95 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NSD3Q9BZ95 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NSD3Q9BZ95 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NSD3Q9BZ95 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NSD3Q9BZ95 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NSD3Q9BZ95 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms