Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms