Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY43

CHMP4A, Charged multivesicular body protein 4a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4AQ9BY43 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHMP4AQ9BY43 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms