Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RNF17Q9BXT8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms