Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
THUMPD2Q9BTF0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms