Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COPS4Q9BT78 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPS4Q9BT78 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms