Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GINS3Q9BRX5 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms