Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNS3Q9BQ31 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms