Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD5Q99666 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms