Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIK3R4Q99570 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIK3R4Q99570 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIK3R4Q99570 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIK3R4Q99570 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIK3R4Q99570 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIK3R4Q99570 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIK3R4Q99570 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIK3R4Q99570 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIK3R4Q99570 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIK3R4Q99570 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIK3R4Q99570 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIK3R4Q99570 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIK3R4Q99570 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIK3R4Q99570 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIK3R4Q99570 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIK3R4Q99570 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIK3R4Q99570 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIK3R4Q99570 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIK3R4Q99570 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PIK3R4Q99570 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
PIK3R4Q99570 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PIK3R4Q99570 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PIK3R4Q99570 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms