Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GCNAQ96QF7 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms