Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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