Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms