Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC7Q96M83 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms