Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms