Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC17Q96LX7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms