Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms