Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC00208Q96KT6 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00208Q96KT6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms